CURSO PRE - CONGRESO ( enlace al pdf de la circular del curso)

 

El comite organizador invita a todos los participantes del 4to. Congreso Nacional de Entomología, a  participar del Curso pre - congreso, a relizarse los dias 10, 11 y 12 de noviembre.

 

 

INTRODUCCION AL ANALISIS FILOGENETICO

 

Fechas: 10 al 12 de Noviembre de 2013

 

Lugar: Museo de Historia Natural Alcide d`Orbigny. Cochabamba – Bolivia.

 

Profesor: Dr. Marco Méndez. Director del laboratorio de Genética y Evolución. Facultad de Ciencias. Universidad de Chile.

 

Objetivo General:   Comprender la teoría y práctica del Análisis Filogenético. 

 

Objetivos específicos: 

a)  Entender los principios básicos relacionados con los análisis filogenéticos. 

b)  Aplicar estos principios en la construcción de árboles filogenéticos. 

c) Analizar en forma crítica estudios recientes con base en reconstrucciones filogenéticas. 

 

 Público objetivo

Este curso está dirigido a estudiantes avanzados, tesistas y profesionales de carreras relacionadas con las ciencias biológicas, básicas o aplicadas, tales como Licenciatura en Biología, Ingeniería Ambiental, Pedagogía en Ciencias, y afines.

 

Cupo: 17 alumnos

Requisitos:                    Estadística, Genética. 

Carga horaria:               24 horas académicas

Duración del curso:      3 días

 

Postulación: Las personas interesadas en participar deberán enviar hasta el 25 de octubre los siguientes documentos en formato .pdf o .doc:

1) Carta de intenciones indicando su motivación para participar del curso

2) Curriculum Vitae

El envío debe realizarse por correo electrónico a las direcciones ivcongreso.ento.bo@gmail.com con copia a cpintonavia@gmail.com indicando en el asunto del correo POSTULACION CURSO FILOGENIA – NOMBRE Y APELLIDO POSTULANTE

 

Organizadores: 4to Congreso Nacional de Entomología/Laboratorio de Genética y Evolución/U. de Chile/Laboratorio de Ecología Química/UMSS /Museo de Historia Natural Alcide d`Orbigny/Centro Cultural Simón I. Patiño. (Mayor información en la página oficial del 4to Congreso Nacional de Entomología: http://ivcongresoentobo.wix.com/4congresoentomologia )

 

PROGRAMA DEL CURSO

 

UNIDAD 1. INTRODUCCIÓN A LA SISTEMÁTICA FILOGENÉTICA.  

 

Día 1   

 

EVOLUCIÓN Y CLASIFICACIÓN BIOLOGICA (GC) 

Sistemática y Taxonomía. 

Tareas de la Sistemática. 

Identificación de los componentes de la Diversidad Biológica. 

Establecimiento de las Relaciones Filogenéticas.  

Clasificación de las especies.  

Inventarios y Colecciones sistemáticas. 

Proyecciones del Análisis Filogenético en otros ámbitos de la biología. 

 

 

Día 1

 

UNIDAD  2.  ESTRATEGIAS  DE  ANÁLISIS  DE  CARACTERES  MORFOLÓGICOS  Y  MOLECULARES.  

 

ANALISIS DE CARACTERES MORFOLOGICOS Y PARSIMONIA: Selección de caracteres morfológicos: aspectos metodológicos. Análisis de caracteres cualitativos (cromosómicos, osteológicos y de la morfología  externa) y caracteres cuantitativos  (morfometría). Análisis de Matrices. (MM)

 

 

Día 2

 

CONCEPTO DE ESPECIE.

Concepto Tipológico. 

Concepto Biológico.  

Concepto de Linaje General de Especie. 

Concepto Filogenético. 

La especie como unidad evolutiva.

Mecanismos de especiación.

Especiación Alopátrica. 

Especiación Simpátrica. 

Especiación Cromosómica. 

 

 

PASO PRÁCTICO 1.    (TARDE) : CONSTRUCCIÓN DE MATRICES Y ANÁLISIS DE CARACTERES MORFOLÓGICOS.

 

 

 

Día 3

 

MÉTODOS DE CONSTRUCCIÓN DE ARBOLES Y CARACTERES MOLECULARES I: Métodos de Parsimonia (repaso), Distancia (Neighbor‐Joining) y Probabilísticos (Likelihood).  Modelos de Sustitución Nucleotídica.

 

CARACTERES MOLECULARES EN SISTEMÁTICA

 

ANÁLISIS SIMULTÁNEO Y PARTICIONADO DE MATRICES DE DATOS

 

MÉTODOS DE CONSTRUCCIÓN DE ARBOLES Y CARACTERES MOLECULARES II:  

Inferencia Bayesiana. Usos y proyecciones

 

PROYECCIONES DEL ANÁLISIS FILOGENÉTICO 

 

RELOJ MOLECULAR. (CI)

 

 

PASO PRÁCTICO 2: Construcción de una hipótesis filogenéticas utilizando caracteres  moleculares. (CC, PM, CI).  (TODO EL DIA)

1) Similitud de secuencias, homología y alineamiento. Uso de programas de 

alineamiento: CLUSTALX.

2) Análisis de matrices de datos usando métodos de  distancia y probabilísticos, uso de programas MEGA, PAUP.   

3) Análisis de matrices de datos de caracteres morfológicos y moleculares: criterios de combinación de matrices usando análisis de Máxima Parsimonia y Máxima Verosimilitud (Likelihood). 

4) Construcción de matrices. Uso de programas filogenéticos: PAUP y Mr. Bayes.

 

 

Literatura recomendada 

 

Albert V (ed). 2006. Parsimony, Phylogeny, and Genomics. Oxford University 

Press, USA; New Ed edition. (MM) 

Avise John C. 1994. Molecular Markers Natural History and Evolution. Chapman 

and Hall. (AV, MM) 

Avise J. C. Phylogeography: The History and Formation of Species. 2000. 

Harvard University Press. (MM) 

Brooks, D.R. and D.A. McLennan. 1991. Phylogeny, Ecology, and Behavior. 

University of Chicago Press, Chicago. (AV, MM) 

Durbin R, Sean Eddy, Anders Krogh, and Graeme Mitchison. 1998. Biological 

Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids. A tutorial 

introduction to Hidden Markov models and other probabilistic modelling 

approaches in computational sequence analysis. Cambridge University 

Press. (MM) 

Harvey, P.H. and M.D. Pagel. 1991. The Comparative Method in Evolutionary 

Biology. Oxford University Press, Oxford, England. (AV, MM) 

Hillis. D. M ,Craig Moritz and Barbara K. Mable. 1996. Molecular Systematics. 

Sinauer Associates Press. (AV, MM) 

Hall B. 2001. Phylogenetic trees Made Easy. Sinauer Associated Press. (AV, MM) 

Page R. D. M., Edward C. Holmes.1998. Molecular Evolution: A Phylogenetic Approach. Blackwell. (MM) 

Nei M. and Sudhir Kumar. 2000. Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford Press. (MM). 

Nielsen R.  (ed) 2005. Statistical Methods in Molecular Evolution (Statistics for Biology and Health) Springer. (MM). 

Wen‐Hsiung Li. 1997.  Molecular Evolution. Sinauer Associates Press. (MM)   

Wiley, E.O. 1981. Phylogenetics: The Theory and Practice of Phylogenetic Systematics. John Wiley and Sons, New York. (AV, MM) 

Wiley, E.O., D. Siegel‐Causey, D.R. Brooks and V.A. Funk. 1991. The Complete Cladist. A Primer of Phylogenetic Procedures. The University of Kansas Museum 

of Natural History Special Publication No. 19. (AV, MM)

Wiens John J. (Editor). 2000. Phylogenetic Analysis of Morphological Data. Smithsonian Series in Comparative Evolutionary Biology. (MM) 

Wheeler Q. and Rudolf Meier (Edit). 2000. Species Concepts and Phylogenetic Theory. Columbia University Press. (MM) 

Yang Ziheng. 2006. Computational Molecular Evolution (Oxford Series in Ecology and Evolution). Oxford University Press, USA. (MM) 

 

Sitios web recomendados

http://www.ucmp.berkeley.edu/clad/clad1.html (Manual de Cladística) 

http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/software.html. 

http://mesquiteproject.org/mesquite/mesquite.html 

http://www.genomicglossaries.com/content/genomics_glossary.asp. 

 

  Costo del curso: Este curso está siendo auspiciado por distintos programas y proyectos de investigación, lo cual nos permite ofrecer a todos los postulantes aceptados un costo final de 100 Pesos Bolivianos o 15 Dólares Americanos para participantes extranjeros. Este costo debe ser cancelado al momento de su aceptación al curso (notificado por correo electrónico) por las mismas vías descritas para la inscripción regular al congreso. El comprobante escaneado de pago debe ser enviado al correo ivcongreso.ento.bo@gmail.com  para confirmar su participación. Colocando en el asunto del correo INSCRIPCION CURSO PRECONGRESO, NOMBRE Y APELLIDO DEL PARTICIPANTE.